Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FXNQ16595 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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