Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR1Q16570 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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