Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZFHX3Q15911 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms