Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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