Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRADDQ15628 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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