Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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