Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PCM1Q15154 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCM1Q15154 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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