Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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