Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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