Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ITGA9Q13797 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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ITGA9Q13797 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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ITGA9Q13797 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA9Q13797 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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