Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHROOM2Q13796 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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