Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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