Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms