Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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