Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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