Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRSQ13332 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRSQ13332 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRSQ13332 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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