Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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