Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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