Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PTPRJQ12913 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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PTPRJQ12913 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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