Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF5Q12774 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF5Q12774 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms