Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCAPQ12770 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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