Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EP300Q09472 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EP300Q09472 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EP300Q09472 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EP300Q09472 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EP300Q09472 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms