Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCBP1Q09161 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms