Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM27E3Q08E93 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM27E3Q08E93 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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