Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PUDPQ08623 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms