Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms