Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APBA1Q02410 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms