Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTBN1Q01082 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms