Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms