Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKD1P98161 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKD1P98161 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKD1P98161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKD1P98161 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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