Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms