Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEP78395 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms