Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC1P78364 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC1P78364 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms