Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTA1P68133 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTA1P68133 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms