Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB38P57729 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB38P57729 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB38P57729 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms