Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms