Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCA2P51587 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms