Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLK1P49759 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLK1P49759 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLK1P49759 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms