Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP4P49662 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP4P49662 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms