Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms