Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms