Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms