Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MLH1P40692 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MLH1P40692 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms