Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIPAP38571 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIPAP38571 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms