Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA4P35212 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJA4P35212 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms