Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms