Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms