Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms