Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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