Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms